Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMAN2Q12907 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.8 ms