Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms