Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TWF1Q12792 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TWF1Q12792 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TWF1Q12792 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TWF1Q12792 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TWF1Q12792 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TWF1Q12792 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TWF1Q12792 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TWF1Q12792 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TWF1Q12792 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TWF1Q12792 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TWF1Q12792 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TWF1Q12792 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TWF1Q12792 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TWF1Q12792 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TWF1Q12792 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TWF1Q12792 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TWF1Q12792 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TWF1Q12792 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TWF1Q12792 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TWF1Q12792 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TWF1Q12792 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TWF1Q12792 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TWF1Q12792 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TWF1Q12792 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TWF1Q12792 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TWF1Q12792 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TWF1Q12792 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TWF1Q12792 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TWF1Q12792 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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