Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NUP160Q12769 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
NUP160Q12769 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
NUP160Q12769 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
NUP160Q12769 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NUP160Q12769 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NUP160Q12769 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NUP160Q12769 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NUP160Q12769 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
NUP160Q12769 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NUP160Q12769 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NUP160Q12769 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NUP160Q12769 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NUP160Q12769 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NUP160Q12769 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NUP160Q12769 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NUP160Q12769 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
NUP160Q12769 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NUP160Q12769 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NUP160Q12769 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NUP160Q12769 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NUP160Q12769 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NUP160Q12769 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NUP160Q12769 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms