Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP4Q09028 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP4Q09028 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms