Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms