Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms