Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE4DQ08499 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms