Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms