Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms