Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.5 ms