Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPEQ02224 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms