Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms