Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HSF1Q00613 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms