Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms