Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms