Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HPCAP84074 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HPCAP84074 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HPCAP84074 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HPCAP84074 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HPCAP84074 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HPCAP84074 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HPCAP84074 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HPCAP84074 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HPCAP84074 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HPCAP84074 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HPCAP84074 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HPCAP84074 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HPCAP84074 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HPCAP84074 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HPCAP84074 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HPCAP84074 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HPCAP84074 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPCAP84074 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPCAP84074 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPCAP84074 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPCAP84074 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPCAP84074 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPCAP84074 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPCAP84074 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPCAP84074 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPCAP84074 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPCAP84074 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPCAP84074 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPCAP84074 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPCAP84074 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPCAP84074 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HPCAP84074 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPCAP84074 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPCAP84074 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPCAP84074 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPCAP84074 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HPCAP84074 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HPCAP84074 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPCAP84074 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPCAP84074 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPCAP84074 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPCAP84074 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPCAP84074 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HPCAP84074 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPCAP84074 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPCAP84074 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPCAP84074 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HPCAP84074 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPCAP84074 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPCAP84074 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPCAP84074 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPCAP84074 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPCAP84074 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPCAP84074 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPCAP84074 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPCAP84074 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPCAP84074 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPCAP84074 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPCAP84074 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPCAP84074 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPCAP84074 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPCAP84074 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPCAP84074 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPCAP84074 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HPCAP84074 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPCAP84074 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPCAP84074 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPCAP84074 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPCAP84074 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPCAP84074 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPCAP84074 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPCAP84074 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HPCAP84074 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPCAP84074 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPCAP84074 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HPCAP84074 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPCAP84074 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HPCAP84074 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPCAP84074 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPCAP84074 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPCAP84074 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPCAP84074 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPCAP84074 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPCAP84074 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPCAP84074 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HPCAP84074 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HPCAP84074 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HPCAP84074 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HPCAP84074 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HPCAP84074 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HPCAP84074 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HPCAP84074 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HPCAP84074 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HPCAP84074 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HPCAP84074 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HPCAP84074 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HPCAP84074 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HPCAP84074 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HPCAP84074 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms