Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNRPNP63162 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPNP63162 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms