Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RPS29P62273 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RPS29P62273 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RPS29P62273 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
RPS29P62273 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RPS29P62273 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RPS29P62273 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
RPS29P62273 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
RPS29P62273 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RPS29P62273 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RPS29P62273 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RPS29P62273 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
RPS29P62273 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RPS29P62273 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RPS29P62273 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RPS29P62273 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RPS29P62273 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
RPS29P62273 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
RPS29P62273 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RPS29P62273 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RPS29P62273 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
RPS29P62273 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS29P62273 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS29P62273 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS29P62273 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS29P62273 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS29P62273 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS29P62273 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS29P62273 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS29P62273 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS29P62273 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS29P62273 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS29P62273 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS29P62273 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS29P62273 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS29P62273 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS29P62273 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS29P62273 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS29P62273 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS29P62273 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS29P62273 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS29P62273 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS29P62273 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS29P62273 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS29P62273 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS29P62273 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS29P62273 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS29P62273 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS29P62273 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS29P62273 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS29P62273 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS29P62273 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS29P62273 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS29P62273 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS29P62273 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS29P62273 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS29P62273 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS29P62273 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS29P62273 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS29P62273 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS29P62273 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS29P62273 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS29P62273 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS29P62273 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS29P62273 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS29P62273 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS29P62273 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS29P62273 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS29P62273 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS29P62273 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS29P62273 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS29P62273 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS29P62273 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS29P62273 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS29P62273 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS29P62273 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS29P62273 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS29P62273 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS29P62273 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS29P62273 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS29P62273 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS29P62273 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS29P62273 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS29P62273 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS29P62273 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS29P62273 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS29P62273 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS29P62273 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS29P62273 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS29P62273 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS29P62273 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS29P62273 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS29P62273 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS29P62273 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS29P62273 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS29P62273 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS29P62273 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS29P62273 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS29P62273 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS29P62273 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
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