Protein–RNA interactions for Protein: P61081

UBE2M, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2MP61081 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2MP61081 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms