Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEFSECP57772 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms