Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB25P57735 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB25P57735 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB25P57735 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB25P57735 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB25P57735 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB25P57735 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB25P57735 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB25P57735 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB25P57735 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB25P57735 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB25P57735 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB25P57735 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB25P57735 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB25P57735 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB25P57735 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB25P57735 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB25P57735 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB25P57735 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB25P57735 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB25P57735 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB25P57735 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB25P57735 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB25P57735 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB25P57735 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB25P57735 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB25P57735 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB25P57735 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB25P57735 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB25P57735 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB25P57735 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB25P57735 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB25P57735 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB25P57735 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB25P57735 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB25P57735 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB25P57735 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB25P57735 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB25P57735 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB25P57735 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB25P57735 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB25P57735 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB25P57735 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB25P57735 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB25P57735 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB25P57735 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB25P57735 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB25P57735 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB25P57735 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB25P57735 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB25P57735 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB25P57735 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB25P57735 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB25P57735 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB25P57735 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB25P57735 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB25P57735 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB25P57735 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB25P57735 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB25P57735 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB25P57735 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB25P57735 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB25P57735 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB25P57735 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB25P57735 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB25P57735 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB25P57735 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB25P57735 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB25P57735 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB25P57735 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB25P57735 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB25P57735 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB25P57735 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB25P57735 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB25P57735 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB25P57735 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB25P57735 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB25P57735 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB25P57735 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB25P57735 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB25P57735 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB25P57735 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB25P57735 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB25P57735 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB25P57735 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB25P57735 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB25P57735 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB25P57735 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB25P57735 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB25P57735 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB25P57735 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB25P57735 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB25P57735 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB25P57735 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB25P57735 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB25P57735 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB25P57735 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB25P57735 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB25P57735 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB25P57735 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms