Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP9P55211 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP9P55211 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP9P55211 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP9P55211 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP9P55211 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP9P55211 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP9P55211 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP9P55211 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP9P55211 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP9P55211 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP9P55211 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP9P55211 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP9P55211 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP9P55211 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP9P55211 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP9P55211 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP9P55211 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP9P55211 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP9P55211 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP9P55211 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP9P55211 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP9P55211 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP9P55211 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP9P55211 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP9P55211 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP9P55211 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP9P55211 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP9P55211 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP9P55211 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP9P55211 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP9P55211 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP9P55211 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP9P55211 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP9P55211 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP9P55211 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP9P55211 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP9P55211 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP9P55211 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP9P55211 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP9P55211 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP9P55211 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP9P55211 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP9P55211 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP9P55211 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP9P55211 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP9P55211 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP9P55211 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP9P55211 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP9P55211 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP9P55211 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP9P55211 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP9P55211 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP9P55211 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP9P55211 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP9P55211 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP9P55211 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP9P55211 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP9P55211 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP9P55211 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP9P55211 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP9P55211 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP9P55211 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP9P55211 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP9P55211 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP9P55211 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP9P55211 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP9P55211 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP9P55211 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP9P55211 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP9P55211 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP9P55211 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP9P55211 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP9P55211 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP9P55211 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP9P55211 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP9P55211 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP9P55211 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP9P55211 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP9P55211 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP9P55211 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP9P55211 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP9P55211 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP9P55211 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP9P55211 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP9P55211 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP9P55211 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP9P55211 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP9P55211 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP9P55211 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP9P55211 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP9P55211 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP9P55211 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP9P55211 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP9P55211 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP9P55211 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP9P55211 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP9P55211 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP9P55211 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP9P55211 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms