Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRPF1P55201 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms