Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms