Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFNA3P52797 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms