Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms