Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF6P49848 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF6P49848 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF6P49848 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF6P49848 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF6P49848 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF6P49848 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF6P49848 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF6P49848 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF6P49848 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF6P49848 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF6P49848 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF6P49848 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF6P49848 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF6P49848 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF6P49848 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF6P49848 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF6P49848 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF6P49848 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF6P49848 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF6P49848 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF6P49848 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF6P49848 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF6P49848 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF6P49848 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF6P49848 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TAF6P49848 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TAF6P49848 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TAF6P49848 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TAF6P49848 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TAF6P49848 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TAF6P49848 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TAF6P49848 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TAF6P49848 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TAF6P49848 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TAF6P49848 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TAF6P49848 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TAF6P49848 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TAF6P49848 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TAF6P49848 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TAF6P49848 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TAF6P49848 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TAF6P49848 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TAF6P49848 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TAF6P49848 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TAF6P49848 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TAF6P49848 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TAF6P49848 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TAF6P49848 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TAF6P49848 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TAF6P49848 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TAF6P49848 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TAF6P49848 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TAF6P49848 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TAF6P49848 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TAF6P49848 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TAF6P49848 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF6P49848 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF6P49848 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF6P49848 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF6P49848 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF6P49848 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF6P49848 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF6P49848 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF6P49848 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF6P49848 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF6P49848 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF6P49848 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF6P49848 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF6P49848 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF6P49848 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF6P49848 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF6P49848 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF6P49848 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF6P49848 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF6P49848 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF6P49848 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF6P49848 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF6P49848 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF6P49848 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF6P49848 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF6P49848 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF6P49848 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF6P49848 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF6P49848 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF6P49848 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF6P49848 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF6P49848 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF6P49848 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF6P49848 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF6P49848 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF6P49848 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF6P49848 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF6P49848 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF6P49848 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF6P49848 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF6P49848 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF6P49848 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF6P49848 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF6P49848 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms