Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CASP4P49662 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CASP4P49662 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CASP4P49662 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CASP4P49662 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CASP4P49662 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CASP4P49662 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CASP4P49662 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CASP4P49662 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CASP4P49662 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CASP4P49662 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CASP4P49662 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CASP4P49662 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CASP4P49662 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CASP4P49662 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CASP4P49662 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CASP4P49662 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CASP4P49662 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CASP4P49662 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CASP4P49662 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CASP4P49662 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CASP4P49662 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CASP4P49662 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CASP4P49662 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CASP4P49662 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CASP4P49662 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CASP4P49662 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CASP4P49662 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CASP4P49662 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CASP4P49662 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASP4P49662 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASP4P49662 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASP4P49662 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASP4P49662 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASP4P49662 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASP4P49662 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CASP4P49662 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASP4P49662 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASP4P49662 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASP4P49662 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASP4P49662 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASP4P49662 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASP4P49662 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASP4P49662 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASP4P49662 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASP4P49662 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASP4P49662 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASP4P49662 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASP4P49662 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASP4P49662 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASP4P49662 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CASP4P49662 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASP4P49662 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASP4P49662 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASP4P49662 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASP4P49662 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CASP4P49662 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CASP4P49662 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASP4P49662 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASP4P49662 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASP4P49662 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASP4P49662 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASP4P49662 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASP4P49662 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASP4P49662 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASP4P49662 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASP4P49662 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASP4P49662 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASP4P49662 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASP4P49662 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASP4P49662 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASP4P49662 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASP4P49662 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASP4P49662 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASP4P49662 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASP4P49662 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASP4P49662 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASP4P49662 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASP4P49662 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASP4P49662 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASP4P49662 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASP4P49662 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASP4P49662 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASP4P49662 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASP4P49662 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASP4P49662 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CASP4P49662 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASP4P49662 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASP4P49662 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASP4P49662 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASP4P49662 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASP4P49662 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASP4P49662 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASP4P49662 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASP4P49662 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASP4P49662 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASP4P49662 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CASP4P49662 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CASP4P49662 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CASP4P49662 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms