Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRIM1P49642 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms