Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD8P48556 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms