Protein–RNA interactions for Protein: P46093

GPR4, G-protein coupled receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR4P46093 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR4P46093 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR4P46093 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR4P46093 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR4P46093 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR4P46093 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR4P46093 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR4P46093 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR4P46093 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR4P46093 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR4P46093 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR4P46093 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR4P46093 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR4P46093 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR4P46093 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR4P46093 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR4P46093 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR4P46093 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR4P46093 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR4P46093 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR4P46093 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR4P46093 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR4P46093 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR4P46093 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR4P46093 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR4P46093 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR4P46093 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR4P46093 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR4P46093 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR4P46093 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR4P46093 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR4P46093 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR4P46093 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR4P46093 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR4P46093 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR4P46093 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR4P46093 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR4P46093 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR4P46093 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR4P46093 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR4P46093 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR4P46093 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR4P46093 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR4P46093 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR4P46093 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GPR4P46093 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GPR4P46093 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GPR4P46093 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GPR4P46093 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GPR4P46093 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPR4P46093 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPR4P46093 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPR4P46093 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPR4P46093 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GPR4P46093 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPR4P46093 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPR4P46093 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPR4P46093 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPR4P46093 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPR4P46093 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPR4P46093 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPR4P46093 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPR4P46093 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GPR4P46093 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPR4P46093 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPR4P46093 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPR4P46093 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPR4P46093 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPR4P46093 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPR4P46093 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPR4P46093 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPR4P46093 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPR4P46093 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPR4P46093 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPR4P46093 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPR4P46093 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPR4P46093 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPR4P46093 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPR4P46093 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPR4P46093 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPR4P46093 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPR4P46093 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPR4P46093 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GPR4P46093 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPR4P46093 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GPR4P46093 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GPR4P46093 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPR4P46093 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPR4P46093 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPR4P46093 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GPR4P46093 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPR4P46093 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GPR4P46093 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPR4P46093 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPR4P46093 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPR4P46093 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPR4P46093 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPR4P46093 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPR4P46093 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPR4P46093 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms