Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPL35P42766 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPL35P42766 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPL35P42766 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPL35P42766 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPL35P42766 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPL35P42766 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPL35P42766 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPL35P42766 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPL35P42766 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPL35P42766 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPL35P42766 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPL35P42766 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPL35P42766 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPL35P42766 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPL35P42766 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPL35P42766 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPL35P42766 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPL35P42766 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPL35P42766 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPL35P42766 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPL35P42766 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPL35P42766 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPL35P42766 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPL35P42766 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPL35P42766 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPL35P42766 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPL35P42766 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPL35P42766 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPL35P42766 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPL35P42766 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPL35P42766 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPL35P42766 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPL35P42766 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPL35P42766 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPL35P42766 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPL35P42766 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPL35P42766 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPL35P42766 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPL35P42766 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPL35P42766 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPL35P42766 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPL35P42766 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL35P42766 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL35P42766 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL35P42766 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL35P42766 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL35P42766 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL35P42766 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL35P42766 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL35P42766 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL35P42766 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL35P42766 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL35P42766 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL35P42766 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL35P42766 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL35P42766 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL35P42766 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL35P42766 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL35P42766 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL35P42766 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL35P42766 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL35P42766 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL35P42766 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL35P42766 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL35P42766 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL35P42766 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL35P42766 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL35P42766 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL35P42766 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL35P42766 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL35P42766 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL35P42766 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL35P42766 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL35P42766 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL35P42766 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL35P42766 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL35P42766 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL35P42766 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL35P42766 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL35P42766 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL35P42766 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL35P42766 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL35P42766 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL35P42766 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL35P42766 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL35P42766 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL35P42766 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL35P42766 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL35P42766 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL35P42766 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL35P42766 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL35P42766 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL35P42766 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL35P42766 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL35P42766 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL35P42766 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL35P42766 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL35P42766 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL35P42766 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms