Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMPOP42166 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMPOP42166 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMPOP42166 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMPOP42166 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMPOP42166 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMPOP42166 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMPOP42166 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMPOP42166 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMPOP42166 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TMPOP42166 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TMPOP42166 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMPOP42166 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMPOP42166 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMPOP42166 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMPOP42166 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMPOP42166 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMPOP42166 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMPOP42166 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMPOP42166 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMPOP42166 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMPOP42166 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMPOP42166 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMPOP42166 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMPOP42166 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMPOP42166 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMPOP42166 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMPOP42166 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMPOP42166 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMPOP42166 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMPOP42166 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMPOP42166 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMPOP42166 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMPOP42166 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMPOP42166 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMPOP42166 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMPOP42166 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMPOP42166 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMPOP42166 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMPOP42166 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMPOP42166 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMPOP42166 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TMPOP42166 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMPOP42166 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMPOP42166 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMPOP42166 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMPOP42166 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TMPOP42166 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMPOP42166 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMPOP42166 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMPOP42166 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMPOP42166 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMPOP42166 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMPOP42166 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMPOP42166 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMPOP42166 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMPOP42166 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMPOP42166 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMPOP42166 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMPOP42166 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMPOP42166 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMPOP42166 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TMPOP42166 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TMPOP42166 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMPOP42166 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMPOP42166 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMPOP42166 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMPOP42166 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMPOP42166 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMPOP42166 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMPOP42166 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMPOP42166 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMPOP42166 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMPOP42166 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMPOP42166 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMPOP42166 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMPOP42166 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMPOP42166 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMPOP42166 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMPOP42166 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMPOP42166 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TMPOP42166 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMPOP42166 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TMPOP42166 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMPOP42166 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMPOP42166 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMPOP42166 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMPOP42166 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMPOP42166 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMPOP42166 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMPOP42166 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMPOP42166 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMPOP42166 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMPOP42166 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMPOP42166 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMPOP42166 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMPOP42166 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMPOP42166 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMPOP42166 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMPOP42166 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms