Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5CP41229 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5CP41229 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5CP41229 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5CP41229 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5CP41229 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5CP41229 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5CP41229 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5CP41229 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5CP41229 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5CP41229 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5CP41229 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5CP41229 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5CP41229 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5CP41229 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5CP41229 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5CP41229 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5CP41229 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5CP41229 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5CP41229 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5CP41229 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5CP41229 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5CP41229 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5CP41229 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5CP41229 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5CP41229 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5CP41229 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5CP41229 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5CP41229 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5CP41229 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5CP41229 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5CP41229 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5CP41229 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5CP41229 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5CP41229 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5CP41229 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC27■■□□□ 1.91
KDM5CP41229 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC27■■□□□ 1.91
KDM5CP41229 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5CP41229 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5CP41229 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5CP41229 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5CP41229 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5CP41229 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5CP41229 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5CP41229 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5CP41229 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM5CP41229 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM5CP41229 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM5CP41229 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms