Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GPC1P35052 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GPC1P35052 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GPC1P35052 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GPC1P35052 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GPC1P35052 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GPC1P35052 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GPC1P35052 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GPC1P35052 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GPC1P35052 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GPC1P35052 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
GPC1P35052 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GPC1P35052 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GPC1P35052 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPC1P35052 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPC1P35052 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPC1P35052 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPC1P35052 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPC1P35052 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPC1P35052 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPC1P35052 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPC1P35052 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPC1P35052 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GPC1P35052 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPC1P35052 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPC1P35052 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPC1P35052 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPC1P35052 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPC1P35052 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPC1P35052 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPC1P35052 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPC1P35052 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPC1P35052 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPC1P35052 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPC1P35052 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPC1P35052 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPC1P35052 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPC1P35052 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPC1P35052 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPC1P35052 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPC1P35052 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPC1P35052 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPC1P35052 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPC1P35052 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPC1P35052 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPC1P35052 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPC1P35052 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPC1P35052 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPC1P35052 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPC1P35052 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPC1P35052 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPC1P35052 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPC1P35052 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPC1P35052 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPC1P35052 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPC1P35052 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPC1P35052 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPC1P35052 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPC1P35052 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPC1P35052 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPC1P35052 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPC1P35052 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPC1P35052 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPC1P35052 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPC1P35052 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPC1P35052 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPC1P35052 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GPC1P35052 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPC1P35052 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GPC1P35052 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GPC1P35052 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPC1P35052 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPC1P35052 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPC1P35052 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPC1P35052 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPC1P35052 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPC1P35052 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPC1P35052 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPC1P35052 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPC1P35052 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPC1P35052 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPC1P35052 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPC1P35052 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPC1P35052 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GPC1P35052 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPC1P35052 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPC1P35052 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPC1P35052 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPC1P35052 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPC1P35052 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPC1P35052 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPC1P35052 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPC1P35052 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPC1P35052 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPC1P35052 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPC1P35052 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPC1P35052 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPC1P35052 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPC1P35052 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPC1P35052 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms