Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms