Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms