Protein–RNA interactions for Protein: P30532

CHRNA5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA5P30532 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA5P30532 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA5P30532 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA5P30532 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA5P30532 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA5P30532 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA5P30532 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA5P30532 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA5P30532 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA5P30532 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA5P30532 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA5P30532 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA5P30532 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA5P30532 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA5P30532 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA5P30532 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA5P30532 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA5P30532 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA5P30532 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA5P30532 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA5P30532 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA5P30532 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA5P30532 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA5P30532 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA5P30532 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA5P30532 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA5P30532 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA5P30532 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA5P30532 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA5P30532 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA5P30532 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA5P30532 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA5P30532 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA5P30532 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA5P30532 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA5P30532 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA5P30532 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA5P30532 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA5P30532 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA5P30532 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA5P30532 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA5P30532 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA5P30532 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA5P30532 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA5P30532 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA5P30532 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA5P30532 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA5P30532 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA5P30532 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA5P30532 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA5P30532 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA5P30532 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA5P30532 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA5P30532 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA5P30532 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA5P30532 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA5P30532 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA5P30532 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA5P30532 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA5P30532 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA5P30532 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA5P30532 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA5P30532 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA5P30532 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA5P30532 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA5P30532 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA5P30532 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA5P30532 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA5P30532 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA5P30532 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms