Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCAP28676 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCAP28676 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCAP28676 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GCAP28676 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCAP28676 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCAP28676 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCAP28676 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCAP28676 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCAP28676 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCAP28676 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCAP28676 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GCAP28676 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GCAP28676 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GCAP28676 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GCAP28676 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GCAP28676 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GCAP28676 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GCAP28676 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GCAP28676 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GCAP28676 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GCAP28676 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GCAP28676 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GCAP28676 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GCAP28676 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GCAP28676 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GCAP28676 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GCAP28676 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GCAP28676 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GCAP28676 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GCAP28676 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GCAP28676 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GCAP28676 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GCAP28676 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GCAP28676 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GCAP28676 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GCAP28676 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GCAP28676 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GCAP28676 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GCAP28676 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GCAP28676 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GCAP28676 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GCAP28676 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GCAP28676 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GCAP28676 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCAP28676 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCAP28676 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCAP28676 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCAP28676 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCAP28676 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCAP28676 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCAP28676 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCAP28676 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCAP28676 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCAP28676 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GCAP28676 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCAP28676 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCAP28676 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCAP28676 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCAP28676 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCAP28676 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GCAP28676 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GCAP28676 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCAP28676 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCAP28676 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCAP28676 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCAP28676 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCAP28676 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCAP28676 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCAP28676 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCAP28676 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCAP28676 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCAP28676 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCAP28676 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCAP28676 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCAP28676 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCAP28676 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCAP28676 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCAP28676 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCAP28676 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCAP28676 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCAP28676 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCAP28676 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCAP28676 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCAP28676 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCAP28676 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCAP28676 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCAP28676 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCAP28676 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCAP28676 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCAP28676 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCAP28676 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GCAP28676 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCAP28676 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GCAP28676 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GCAP28676 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCAP28676 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCAP28676 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCAP28676 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCAP28676 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms