Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
POLD1P28340 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
POLD1P28340 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLD1P28340 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLD1P28340 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLD1P28340 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLD1P28340 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLD1P28340 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLD1P28340 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
POLD1P28340 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLD1P28340 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLD1P28340 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLD1P28340 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
POLD1P28340 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLD1P28340 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLD1P28340 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLD1P28340 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLD1P28340 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLD1P28340 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLD1P28340 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLD1P28340 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLD1P28340 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
POLD1P28340 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
POLD1P28340 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLD1P28340 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
POLD1P28340 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLD1P28340 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLD1P28340 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
POLD1P28340 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
POLD1P28340 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLD1P28340 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLD1P28340 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLD1P28340 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLD1P28340 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLD1P28340 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLD1P28340 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
POLD1P28340 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLD1P28340 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLD1P28340 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLD1P28340 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLD1P28340 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLD1P28340 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLD1P28340 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
POLD1P28340 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLD1P28340 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLD1P28340 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLD1P28340 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLD1P28340 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLD1P28340 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLD1P28340 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLD1P28340 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLD1P28340 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLD1P28340 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLD1P28340 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLD1P28340 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
POLD1P28340 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
POLD1P28340 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLD1P28340 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLD1P28340 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLD1P28340 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLD1P28340 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLD1P28340 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLD1P28340 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLD1P28340 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
POLD1P28340 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
POLD1P28340 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
POLD1P28340 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLD1P28340 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLD1P28340 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLD1P28340 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLD1P28340 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLD1P28340 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLD1P28340 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLD1P28340 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLD1P28340 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLD1P28340 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLD1P28340 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLD1P28340 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLD1P28340 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLD1P28340 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLD1P28340 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLD1P28340 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLD1P28340 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLD1P28340 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLD1P28340 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
POLD1P28340 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
POLD1P28340 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLD1P28340 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLD1P28340 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLD1P28340 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLD1P28340 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLD1P28340 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLD1P28340 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLD1P28340 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLD1P28340 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLD1P28340 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLD1P28340 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
POLD1P28340 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLD1P28340 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLD1P28340 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms