Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
LMO2P25791 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LMO2P25791 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LMO2P25791 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
LMO2P25791 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LMO2P25791 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LMO2P25791 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LMO2P25791 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LMO2P25791 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LMO2P25791 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LMO2P25791 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LMO2P25791 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LMO2P25791 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LMO2P25791 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LMO2P25791 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LMO2P25791 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LMO2P25791 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LMO2P25791 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LMO2P25791 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LMO2P25791 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LMO2P25791 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LMO2P25791 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LMO2P25791 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LMO2P25791 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LMO2P25791 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LMO2P25791 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
LMO2P25791 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LMO2P25791 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LMO2P25791 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
LMO2P25791 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LMO2P25791 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LMO2P25791 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LMO2P25791 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LMO2P25791 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LMO2P25791 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LMO2P25791 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LMO2P25791 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LMO2P25791 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LMO2P25791 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LMO2P25791 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LMO2P25791 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LMO2P25791 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LMO2P25791 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LMO2P25791 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LMO2P25791 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LMO2P25791 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LMO2P25791 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LMO2P25791 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LMO2P25791 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LMO2P25791 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LMO2P25791 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LMO2P25791 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LMO2P25791 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LMO2P25791 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LMO2P25791 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LMO2P25791 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LMO2P25791 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LMO2P25791 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LMO2P25791 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LMO2P25791 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LMO2P25791 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LMO2P25791 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LMO2P25791 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LMO2P25791 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LMO2P25791 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LMO2P25791 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LMO2P25791 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LMO2P25791 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LMO2P25791 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LMO2P25791 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LMO2P25791 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LMO2P25791 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LMO2P25791 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LMO2P25791 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LMO2P25791 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LMO2P25791 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LMO2P25791 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LMO2P25791 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LMO2P25791 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LMO2P25791 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LMO2P25791 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LMO2P25791 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LMO2P25791 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LMO2P25791 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LMO2P25791 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LMO2P25791 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LMO2P25791 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
LMO2P25791 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LMO2P25791 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LMO2P25791 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LMO2P25791 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LMO2P25791 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LMO2P25791 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LMO2P25791 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LMO2P25791 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LMO2P25791 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LMO2P25791 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LMO2P25791 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LMO2P25791 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LMO2P25791 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms