Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms