Protein–RNA interactions for Protein: P21810

BGN, Biglycan, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BGNP21810 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BGNP21810 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BGNP21810 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BGNP21810 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BGNP21810 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BGNP21810 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BGNP21810 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BGNP21810 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BGNP21810 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BGNP21810 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BGNP21810 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BGNP21810 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BGNP21810 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BGNP21810 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BGNP21810 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BGNP21810 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BGNP21810 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BGNP21810 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BGNP21810 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BGNP21810 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BGNP21810 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BGNP21810 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BGNP21810 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BGNP21810 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BGNP21810 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BGNP21810 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BGNP21810 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BGNP21810 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BGNP21810 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BGNP21810 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BGNP21810 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BGNP21810 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BGNP21810 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BGNP21810 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BGNP21810 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BGNP21810 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BGNP21810 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BGNP21810 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BGNP21810 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BGNP21810 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BGNP21810 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BGNP21810 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BGNP21810 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BGNP21810 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BGNP21810 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
BGNP21810 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BGNP21810 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
BGNP21810 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
BGNP21810 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BGNP21810 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BGNP21810 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BGNP21810 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BGNP21810 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BGNP21810 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BGNP21810 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BGNP21810 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BGNP21810 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BGNP21810 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BGNP21810 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BGNP21810 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BGNP21810 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BGNP21810 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BGNP21810 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BGNP21810 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BGNP21810 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BGNP21810 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BGNP21810 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BGNP21810 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BGNP21810 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BGNP21810 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BGNP21810 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BGNP21810 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BGNP21810 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BGNP21810 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BGNP21810 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BGNP21810 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BGNP21810 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BGNP21810 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BGNP21810 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BGNP21810 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BGNP21810 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BGNP21810 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BGNP21810 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BGNP21810 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BGNP21810 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BGNP21810 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BGNP21810 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BGNP21810 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BGNP21810 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BGNP21810 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BGNP21810 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BGNP21810 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BGNP21810 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BGNP21810 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BGNP21810 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BGNP21810 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BGNP21810 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BGNP21810 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BGNP21810 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BGNP21810 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms