Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms