Protein–RNA interactions for Protein: P17036

ZNF3, Zinc finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3P17036 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms