Protein–RNA interactions for Protein: P14317

HCLS1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1P14317 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HCLS1P14317 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HCLS1P14317 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HCLS1P14317 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HCLS1P14317 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HCLS1P14317 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HCLS1P14317 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HCLS1P14317 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HCLS1P14317 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HCLS1P14317 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HCLS1P14317 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HCLS1P14317 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HCLS1P14317 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HCLS1P14317 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HCLS1P14317 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms