Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms