Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GP1BBP13224 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GP1BBP13224 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms