Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL3P10147 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL3P10147 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL3P10147 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL3P10147 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL3P10147 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL3P10147 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL3P10147 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL3P10147 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL3P10147 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL3P10147 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL3P10147 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL3P10147 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL3P10147 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL3P10147 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL3P10147 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL3P10147 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL3P10147 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL3P10147 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL3P10147 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL3P10147 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL3P10147 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL3P10147 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL3P10147 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL3P10147 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL3P10147 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL3P10147 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL3P10147 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL3P10147 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL3P10147 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL3P10147 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL3P10147 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL3P10147 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL3P10147 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL3P10147 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL3P10147 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL3P10147 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL3P10147 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL3P10147 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL3P10147 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL3P10147 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL3P10147 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL3P10147 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL3P10147 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL3P10147 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL3P10147 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL3P10147 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL3P10147 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL3P10147 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL3P10147 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL3P10147 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3P10147 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3P10147 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3P10147 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3P10147 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3P10147 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3P10147 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3P10147 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3P10147 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3P10147 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3P10147 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3P10147 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3P10147 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3P10147 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3P10147 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3P10147 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3P10147 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3P10147 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3P10147 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3P10147 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3P10147 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3P10147 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3P10147 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3P10147 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3P10147 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3P10147 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3P10147 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3P10147 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3P10147 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3P10147 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3P10147 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3P10147 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3P10147 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3P10147 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3P10147 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3P10147 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3P10147 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3P10147 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3P10147 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3P10147 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3P10147 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3P10147 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3P10147 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3P10147 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL3P10147 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL3P10147 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL3P10147 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL3P10147 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL3P10147 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL3P10147 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms